Pro hledání ve většině databází je prakticky nutností získat identifikátor sloučeniny a ten použít pro sestavení dotazu. Zde máme najít nejrozšířenější identifikátor: CAS RN (nezávislý na struktuře) a vytvořit nebo najít název a identifikátory odvozené ze struktury: INChI a SMILES.
Pro nalezení CAS RN můžeme použít mnoho metod, záleží na konkrétní situaci, která z nich bude optimální:
Nalezené CAS RN je vhodné ověřit zadáním v databázi CA a porovnáním takto nalezené sloučeniny se zadáním. Nemáme-li přístup k databázi CA, pak aspoň ověřit ve více nezávislých zdrojích.
Identifikátory odvozené ze struktury lze opět získat buď hledáním, nebo i vygenerovat z nakresleného strukturního vzorce, např. pomocí programu BKChem [46].
Největší volně přístupná databanka chemických sloučenin PubChem [47] nabízí obě možnosti – identifikátory INChI a SMILES najít nebo vygenerovat. Mimo jiné je k dispozici též vygenerovaný název podle pravidel IUPAC.
Software AutoNom [48] vygeneruje název z nakresleného strukturního vzorce.
Video 15.1. : Vygenerování názvu sloučeniny pomocí programu AutoNom. (00:52)
Video 15.2. : Vygenerování identifikátoru INChI ze strukturního vzorce v programu BkChem. (00:18)
Video 15.3. : Vygenerování identifikátoru SMILES ze strukturního vzorce v programu BkChem. (00:16)
Ověření, že CAS RN 100-46-9 přísluší zadanému benzenmethanaminu. Nejjednodušší postup je použít CA a vyhledat sloučeninu podle CAS RN.
Video 15.5. : Ověření správnosti nalezeného CAS RN. (00:35)
This work is licensed under a
Creative Commons Attribution-Noncommercial-Share Alike 3.0 Unported License.